Предлагат се много различни видове четци за електронни книги и всяко устройство има своите плюсове и минуси. Файловете за електронни книги също се предлагат в много различни формати и никой четец не може да се справи с всички тях. Kindle поддържа голям брой съществуващи формати, или естествено, или с преобразуване. Няколко файлови формата изискват използването на специален софтуер, за да бъдат съвместими с Kindle.
AZW: Основният формат
Форматът "AZW" се използва за електронни книги, които купувате в магазина Kindle на Amazon. Това е предпочитаният формат, за да се осигури максимална четливост на устройството. Форматът е собственост и всъщност е вариант на MOBI формата, първоначално създаден от френската компания Mobipocket. Amazon закупи Mobipocket и адаптира формата за използване на Kindle.
Други естествени формати
Kindle може да показва някои други формати на електронни книги, което означава, че тези файлове могат да се зареждат директно в устройството и да се четат по същия начин като AZW файл. MOBI файловете и PRC файловете (формат, използван на Palm) могат да бъдат прочетени, ако не съдържат защита на управлението на цифровите права (DRM). DRM обикновено ограничава книгата до едно устройство за четене. Освен това Kindle може да обработва файлове с обикновен текст (TXT) и PDF формат на Adobe, въпреки че не всички PDF файлове се показват добре на Kindle.
Налично чрез преобразуване
Преобразуването обикновено включва изпращане на файл на вашия имейл адрес на Kindle. Amazon казва, че може да конвертира HTML, DOC (файл на Microsoft Word) и графичните файлови формати JPEG, GIF, PNG и BMP. Сега някои хора използват Kindle, за да четат сканирани комикси за манга; програма, наречена Mangle, ви позволява да конвертирате манга, ако е сканирана в един от графичните файлови формати, поддържани от Kindle.
Аудио формати
Kindle може да възпроизвежда аудио файлове. Музикалните файлове, запазени във формат MP3, са съвместими, както и аудио книгите от Audible.com, който също е собственост на Amazon. Тези файлове са във формати Audible (AA) и Audible Enhanced (AAX).
Неподдържани формати
Най-широко използваният формат, който не се поддържа от Kindle, е форматът с отворен код EPUB, използван от много други електронни четци като Nook от Barnes и Noble. Amazon евентуално може да добави EPUB съвместимост към Kindle; междувременно безплатни програми като Calibre могат да се използват за конвертиране на електронни книги от EPUB във формат AZW. Други формати като LIT (MS Reader) и LRF (формат Sony) също могат да бъдат конвертирани по този начин. Успехът на тези реализации може да бъде пропуснат, но те са опции, достъпни за потребителите на Kindle.