От социалните мрежи до игрите до фотографията с реколта, iPhone и приложенията вървят ръка за ръка. Въпреки че феновете на iPhone непрекъснато търсят най-новата и най-добрата от тези компактни програми, iPhone излиза от кутията с повече от 20 вградени или „родни“ приложения. За iPhone 5 Apple актуализира много от родните приложения на iPhone, за да приспособи по-големия размер на екрана на телефона и операционната система iOS 6.
Комуникация
В допълнение към основните приложения за телефон и текстови съобщения на устройството, iPhone разполага с FaceTime, вградена програма за видеообаждания за разговори лице в лице и Mail, приложение, което работи с множество доставчици на имейл, за да позволи достъп до имейл от вашия смартфон. За сърфиране в мрежата браузърът Safari на Apple идва с iPhone 5, оптимизиран за 4-инчовия дисплей на ретината на телефона. Както Mail, така и Safari работят със системата iCloud, като синхронизират вашия имейл и браузър с други устройства на Apple. Приложението Контакти записва имена, имейл адреси, телефонни номера и информация за социални мрежи на хора във вашия социален кръг.
Мултимедия
Приложението Camera на iPhone 5 работи съвместно с 8-мегапикселовата камера iSight на телефона за заснемане, редактиране и споделяне на снимки и HD видео. Приложенията Музика, Видео и Снимки ви позволяват да съхранявате, организирате, преглеждате и споделяте мултимедията си на вашия iPhone. Версията на iTunes на Apple за iOS 6 работи като по-големите си братя и сестри, което ви позволява да изтегляте музика, HD филми и телевизионни предавания. Това приложение се синхронизира с домашните версии чрез iCloud. Родният Game Center следи вашите резултати и постижения в многобройни игри за iPhone.
Комунални услуги
Maps, едно от най-изявените приложения на iPhone, предлага GPS-задвижвана, поетапна навигация с комбинация от 3-D и 2-D изгледи на улици, включително актуализации на трафика в реално време. По-опростените приложения като Календар и Напомняния ви позволяват да създадете цифрово планиране и да задавате съответно предупреждения, базирани на времето, докато Notes работи като универсална виртуална скречпад. IPhone 5 включва още калкулатор, записващо устройство за гласова бележка и приложения, които предоставят информация за времето и фондовата борса.
Други
Siri, „интелигентният асистент“ на Apple, работи в множество приложения, за да предоставя информация и да изпълнява задачи, които включват изпращане на текстови съобщения и търсене на спортни резултати и време за показване на филми чрез гласови команди на потребителя. За тези, които се занимават с тромава колекция от купони, билети, карти за подаръци и пропуски, Passbook поддържа всички тези елементи в консолидиран цифров формат - всяка карта или пропуск може да бъде сканирана от устройството. Лесното, но полезно приложение Find My iPhone използва GPS данни за дистанционно намиране на вашия неуместен iPhone от вашия компютър с активиран iCloud. Ако установите, че родните приложения на телефона липсват, родният App Store ви позволява да разглеждате и купувате повече от 700 000 приложения на трети страни.